تم إحداث مركز تطوير التعليم الطبي في جامعة دمشق بناءً على قرار مجلس التعليم العالي رقم 172 تاريخ 24/5/2009، وقد جاء هذا بعد إنشاء المركز سابقاً كمركز استشاري في جامعة دمشق لتطوير التعليم الطبي بالقرار رقم 1009 / 1009 م تاريخ 27/11/1999.